2009年１月22日、インドネシア保健省は、Ｈ５Ｎ１型鳥インフルエンザのヒトへの感染を新たに２例報告した。１例目は、バンテン州タンゲランの29歳の女性で、12月11日に発症。12月13日に入院したが、12月16日に死亡。調査によると患者は、鶏肉を含む生鮮食料品を購入するため、毎日市場を訪れていた。患者と接触した家族の健康状態を監視したが、発症したものはない。２例目は、西ジャワ州ベカシ市の５歳の女児で、12月23日に発症。12月27日に入院したが、１月２日に死亡。調査によると患者は、発症の２日前に市場を訪れ、鶏肉と卵を購入していた。接触者の健康状態を監視したが、発症したものはいない。 ２例とも、Ｈ５Ｎ１型鳥インフルエンザウイルスが検査で確定された。

インドネシアでは、141症例が確定され、115例が死亡している。